Rotorr-Motor de Innovación surgió como resultado de un profundo proceso de reflexión en la Universidad Nacional de Colombia, que comenzó hace varias décadas con la creación de diversos programas de apoyo al emprendimiento.

A lo largo de los años, el Sistema de Investigación de la Universidad se ha consolidado, lo que llevó, en 2015, al desarrollo del primer modelo de la Oficina de Transferencia de Resultados de Investigación (OTRI). Este modelo puso de manifiesto la necesidad urgente de contar con vehículos financieros más eficientes para apoyar las Tecnologías Profundas, también conocidas como Deep Tech.

La creación de la Ley de Spin-off y la implementación de estrategias clave, como el Programa Méntor y el proyecto de inversión de la Universidad Nacional de Colombia en Innovación, Transferencia de conocimiento y Emprendimiento (ITEM), fueron fundamentales para el origen de la corporación en 2023.